医科大学最好的是医学霸主，北京协和医学院；其次是南北医学双雄，北方的是北京医科大学（北京大学），上海医科大学（复旦大学）。然后是军地医学四大精英，最后是医学十一大金刚。
协和医学院；是国内最顶尖的医科大学，与中国医学科学院院校一体，科研实力雄厚，被誉为中国医学殿堂。学校一直以来都是坚持小规模招生、高层次培养、高质量输出，所以每年的本科招生一般就在一两百人左右而已。与清华大学实行紧密合作办学，同时使用“北京协和医学院--清华大学医学部”作为第二名称，学校仍为独立法人单位。
复旦大学上海医学院；源自以前的上海医科大学，在我国医学界十分有名，实力很强。与美国哈佛大学医学院、杜克大学医学院、哥伦比亚大学医学院等海外知名院校建立了院际关系，开展在读医学生的互换实习等活动。现有附属医院11所。设有本科专业9个：临床医学（八年制）、临床医学（五年制）、临床医学（六年制）、基础医学、法医学、预防医学、公共事业管理、药学、护理学。
北京大学医学部；国内一流的医学院校，毕业后颁发的是北京大学的学位证和毕业证，含金量自然不用多说，个别学科上跟协和医学院不分伯仲。现有6家附属医院、4家共建医院和14家教学医院。
上海交大医学院；学科综合实力稳居国内前列，其中临床医学专业八年制在教育部公布的《学位学科评估高校排名结果》中本专业排名第一位。如今拥有两个校区（重庆南路校区、闵行校区），23个学院和13所附属医院。
中山大学中山医学院；华南地区首屈一指的医科院校，无论是教学、科研、临床方面，在广东属于一位难求的好学校，师资雄厚，和清华北大也是有得一拼的。现有附属医学7所。本科招生的专业有：临床医学（八年制）、临床医学（五年制）、法医学、临床医学 (眼科视光学方向)（五年制）、麻醉学（五年制）、医学影像学(五年制)、医学检验（五年制）、康复治疗学、生物医学工程等。
华中科技大学同济医学院；中国老牌医学院之一，原为同济医科大学，合并之后实力反而不如以前了，公共卫生学院在国内排名第一，实力相当强。如今拥有3所直属附属医院和10所非直属附属医院。
中南大学湘雅医学院；久负盛名的老牌医科院校，素有“北协和，南湘雅”之称。临床医学、药理学与毒理学、生物学与生物化学、神经科学与行为科学4个学科ESI（基本科学指标）排名居全球前1%。拥有6所学院，5所直属附属医院和2所非直属附属医院，以及24个临床教学基地。
浙江大学医学院；原为浙江医科大学，并入浙江大学之后，对医学的投入很大，医学院发展势头强劲，排名上升非常快。如今实力也在不断提升，已经不输湘雅、同济，拥有7家附属医院。
首都医科大学；学科实力雄厚，在北方地区总体评价很不错，实力不逊于很多211高校。首医的附属医院很多，而且每个都很牛很有名，现有20所临床医学院暨附属医院，包括首都医科大学宣武医院、附属北京友谊医院、附属北京朝阳医院、附属北京同仁医院、附属北京天坛医院等等。
四川大学华西医学中心；全国门类最全、规模最大的医科大学，在西南地区首屈一指。口腔医学院是华西的招牌，也是中国第一个口腔专科医院，现在拥有4所附属医院。
第三层次：军地医学四大精英。地方四大精英：同济医科大学（华中科技大学），中山医科大学（中山大学），华西医科大学（四川大学），湖南医科大学湘雅医学院（中南大学）。军队医学四大精英：第一军医大学（南方医科大学），第二军医大学（中国人民解放军海军军医大学），第三军医大学（中国人民解放军陆军军医大学），第四军医大学（中国人民解放军空军军医大学）。
上海第二医科大学（上海交通大学），首都医科大学，中国医科大学，西安医科大学（西安交大），山东医科大学（山东大学），白求恩医科大学（吉林大学），浙江医科大学（浙江大学），哈尔滨医科大学，天津医科大学，重庆医科大学，南京医科大学。
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